Судьи Высшего Суда Справедливости БАГАЦа поначалу не хотели ставить свои подписи под решением о разрушении синагог. БАГАЦ опубликовал постановление, в котором призывал Ариэля Шарона официально обратиться к руководству ПА и к международным организациям, чтобы предотвратить разрушение синагог. Судьи ознакомились с галахическим постановлением, категорически запрещающим разрушать синагоги. Представители главного раввината утверждали, что правительство не дало официальный запрос ПА и международным организациям. А представители правительства утверждали в суде, что подобное обращение невозможно. В конце концов БАГАЦ вынес решение, позволяющее начать разрушение синагог.
Однако в последний момент министр обороны Шауль Мофаз обратился к Шарону с просьбой отложить разрушение. 11 сентября правительство приняло решение не разрушать синагоги. Эти здания строились с учетом постоянной опасности обстрелов, и в случае положительного решения бульдозеры здесь будут бессильны, и армии Израиля пришлось бы их взрывать. Правительство решило, что это хуже, чем опасность осквернения храмов палестинцами.